病虫害[病虫害病害和虫害的并称，常对农、林、牧业等造成不良影响。]防治[防治是一个汉语词汇，拼音为fáng zhì，译为预防和治疗或预防和治理。]
1、生产环境卫生治理。在科学合理场地选址和设计基础上，要在生产前进行全面灭菌、除虫、去除四周杂物、保持环境干净、整洁；在设计上，灭菌锅、锅炉房到接种室、培养室距离要尽量短，减少在操作运输过程中被污染的机会；菌丝培养室和出菇房要有防范措施，在门窗和通气口处装细眼纱窗，防止菇蝇、菇蚊等虫源飞入；门窗要严密，防老鼠钻入为害培养料及子实体；进行保护地或室外栽培的要将周围杂草、落叶、碎石清除干净，沿四周撒上生石灰粉，防止白蚁和其它害虫进入。工作人员必须严格按照正规的生产规程进行生产，减少不必要损失。
2、生态防治。主要通过控制食用菌[食用菌是指子实体硕大、可供食用的蕈菌（大型真菌），通称为蘑菇。]培养过程中生态环境条件，促使食用菌快速健壮生长[生长是自然界中存在的一种自然现象。]，抑制各种杂菌[杂菌是在微生物的分离、及纯培养过程中出现的与分离培养菌种不同的其他菌种。]生长繁殖，最终实现促菇抑病的目的。
(1)温度。不同食用菌品种具有特定的生长温度范围，在这范围内菌丝生长速度快，目前人工栽培的品种生长阶段的温度大多在18～26℃。为防霉菌污染，一般要将温度控制在26℃以下，可有效地防止喜高温霉菌污染。
(2)湿度。大多数的霉菌在高湿条件下繁殖，在食用菌菌丝生长阶段将环境湿度控制在70％以下，可有效的抑制喜湿杂菌生长。
(3)酸碱度[酸碱度描述的是水溶液的酸碱性强弱程度，用pH值来表示。]。不同的食用菌品种对pH值要求不一样，如草菇pH值偏高环境生长良好，且pH值高可抑制喜中性、偏酸性杂菌生长。在配制培养基时，适量加入KH2PO4，既可补充钾，又起到调节酸碱度作用，也能起到抑制杂菌生长的作用。
(4)增强通风，适宜光照。食用菌为好气性真菌，而多数杂菌在闷热不通风条件孳生，加强通风既有促进食用菌生长的作用，又有抑制杂菌生长功能，适宜的散射光促进食用菌菌丝生长健壮，增强抵制杂菌能力。
3、物理防治。物理防治可利用高压、日光曝晒、黑光灯诱杀[故事讲述的是村子里做炮仗的石永强因一次贪睡，而错过了村子的撤离，石永强看似嬉笑怒骂，放荡不羁，但面对鬼子的“诱杀”，开始了一段勇敢而又机智的“反诱杀”。]及过滤除菌等物理原理达到防病杀虫的目的。物理防治简单易行、不易伤人体，不污染环境。物理防治病虫害应用十分广泛，如：食用菌害虫对光波敏感，具趋光性，可以利用黑光灯诱杀，在灯下放入一些装有0.1％敌敌畏水盆或安装电灭蚊器，可以诱杀双翅目的眼菌蚊、蚤蝇、粪蝇、瘦蚊和鞘翅目的缨甲科害虫；利用电子灭菌器，可以杀菌消毒。
4、生物防治[生物防治（biological control），就是利用一种生物对付另外一种生物的方法。]。利用生物和生物代谢物[代谢物亦称中间代谢物，是指通过代谢过程产生或消耗的物质，生物大分子不包括在内。]达到防病防虫的目的。生物防治在农业上广泛应用，但在食用菌上应用刚刚起步，前景十分乐观，因为它不污染环境，没有残毒、对人体无害、长期使用没有副作用，使食用菌产品无公害[无公害，指有毒有害物质控制在安全允许范围内，符合《国标》的产品，多指农产品。]。目前食用菌生物防治以生物的代谢物和提取物杀虫杀菌为常见，如：用180～210毫克／升链霉素[链霉素（streptomycin）是一种氨基糖苷类抗生素。]防治革兰氏阳性细菌引起的病害；用玫瑰链霉素280～320毫克／升防治红银耳病；金霉素130～220毫克／升防治细菌性腐烂病；利用细菌制剂－苏云金杆菌来防治蜗类、蝇类、蚊类、线虫都取得很好效果；利用植物制剂－鱼藤精、烟草浸出液和其它生物制剂，都对食用菌病虫害有理想的防治效果。
5、化学防治。可以选择高效、低毒、易分解化学农药[化学农药广泛的运用在农业生产之中。]来防治，尽量避免使用高毒、难分解化学农药防治病虫害，保证食用菌产品无公害。杀虫剂[杀虫剂（Pesticide. Insecticide ），主要用于防治农业害虫和城市卫生害虫的药品．使用历史长远、用量大、品种多。]可选用乐果、敌百虫、杀灭菊酯和生物性杀虫剂青白菌、白僵菌以及植物性杀虫剂除虫菊等。还可选用驱避剂樟脑丸以及诱杀剂糖醋液等。熏蒸集可以用**铝代替也可用紫外灯进行代替。杀菌剂选用代森铵、稻瘟净、抗生素、井冈山素以及植物杀菌素大蒜素等。这些药物对病虫均有较好的防治作用，而对环境和食用菌几乎无污染。
采收
各种食用菌产品达到最佳商品价值时，应该立即采收处理。如果是鲜售，采后立即打包装作低温保鲜处理，以最短时间到达消费者手中。如果用于加工处理，也应该立即作出处理，以防变质变味，影响品质。