在生产实践中，不少种植番茄[番茄，别名西红柿、洋柿子。]的菜农会遇到这种问题，番茄的茎秆[茎秆，纤维素（cellulose）是由葡萄糖组成的大分子多糖。]发黑，发病轻时植株生长缓慢，长势渐弱，产量下降；严重时植株直接萎蔫枯死。由于引起番茄“黑秆子[拼音gǎnzǐ解释某些植物的茎：高粱～。]”的原因有很多，若不能对症下药就很难得到有效防治[防治是一个汉语词汇，拼音为fáng zhì，译为预防和治疗或预防和治理。]。因此，很多菜农朋友对番茄“黑秆子”病头疼不已。
番茄“黑秆子”按照发病部位可分为两种，一是茎基部[基部，就是所谓的“形态学下端”，具体到一棵植物来说就是茎与根交界的部分。]出现褐变发黑，另一种是茎秆中上部或分杈处出现黑褐斑等。
一、茎基部“黑秆子”
通常情况下，番茄茎基部出现“黑秆子”是由茎基腐病、疫霉根腐病[根腐病是一种真菌引起的病，该病会造成根部腐烂，吸收水分和养分的功能逐渐减弱，最后全株死亡，主要表现为整株叶片发黄、枯萎。]这两种病害引起的。
茎基腐病，也称大苗立枯病，该病的识别关键点是茎基部病斑绕茎一周，缢缩，后期可见淡褐色蛛丝状霉，植株逐渐枯萎而死。防治该病可用20%的甲基立枯磷乳油1200倍液混加95%的绿亨一号（恶霉灵）3000倍液进行灌根。
疫霉根腐病，茎基部产生深褐斑，逐渐扩大后绕茎一周，病斑凹陷，与茎基腐病不同的是，纵剖茎基部可见导管变褐色，而茎基腐病则没有。防治该病可用72.2%的普力克800倍液混加50%的DT500倍液混加80%的金纳海（福美双）750倍液进行灌根。
二、茎秆或分杈处“黑秆子”
茎秆或分杈处“黑秆子”通常由番茄早疫病、晚疫病[病原中文学名：致病疫霉（Phytophthora infestans） 界：真菌界 门：真菌门(Eumycophyta) 亚门：鞭毛菌亚门(Mastigomycotina) 纲：卵菌纲(Oomycetes) 目：霜霉目(Peronosporales) 科：腐霉科(Pythiaceae) 属：疫霉属(Phytophthora)症状识别属真菌病害，幼苗、成株均可发病，可为害叶、茎、果，但以成株期的叶片和青果受害较重。]、茎枯病、条斑病毒病这几种病害引起。
早疫病，茎秆或分杈处产生不规则褐斑，湿度大时有黑色霉层。晚疫病，茎秆或分杈处变细且呈黑褐色，病果上有明显的云彩斑。防治早疫病的主要药品是代森锰锌，而防治晚疫病的主药是甲霜灵，因此防治以上这两种病害可直接喷施68%的金雷多米尔（精甲霜灵+代森锰锌）800倍液进行防治。
茎枯病，茎秆上产生椭圆形褐色病斑，上下扩展，后期病斑可侵入到维管束[维管束是指维管植物（包括蕨类植物、*子植物和被子植物）的维管组织，由木质部和韧皮部成束状排列形成的结构。]中，引起该病的病原菌与早疫病相同，都是茄链格孢菌，防治时同样以代森锰锌为主药，除了喷施金雷多米尔外，还可喷施50%的扑海因可湿性粉剂1000倍液。
条斑病毒病，茎秆上产生黑褐色斑块，与茎枯病不同的是发病部位多在植株生长点附近，且病斑变色部位仅发生在表皮，不会深入至维管束，这是区别两者的关键。防治该病时，需在发病初期喷洒2%的宁南霉素水剂500倍液，或20%的病毒A可湿性粉剂500倍液。