为什么菌肥[菌肥，亦称生物肥、生物肥料、细菌肥料或接种剂等。]用后效果不明显？菌肥用后效果不明显的原因是什么？据悉，菌肥顾名思义就是菌+肥，菌就是各种有益微生物[微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。]，肥可以是有机肥[主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。]，也可以是氮、磷、钾、中微量元素等无机肥料。
为什么菌肥用后效果不明显
一、土壤[土壤（英文名称：Soil）位于地球陆地表面，具有一定肥力，能够生长植物的疏松层。]菌肥不匹配
土壤有酸碱之分，有机菌肥也有pH值，菌又有、之分。中性和微酸性土壤宜施性有机菌肥。碱性土壤宜施丝状微生物的藻类有机菌肥，施用[施用是一个汉语词语，拼音：shì yòng释义：1. 施行，实行。]后能固定空气中的氮，帮助果树利用其他状态存在的氮素养分。
酸性土壤施了碱性有机菌肥，酸碱中和降低了肥效，也使菌种[用于发酵过程作为活细胞催化剂的微生物，包括细菌、放线菌、酵母菌和霉菌四大类。]受到伤害。有些菌是需氧性很强的菌种，如放线菌、霉菌类等施在板结透气性[透气性是指气体对薄膜、涂层、织物等高分子材料的渗透性。]差的土壤中，别说发酵繁殖，菌种本身都难以成活。
二、土壤理化性状恶化
菌肥中的菌赖以生存[这是一个四字短语，释义为：依赖着一个物品、东西生活，生存。]的条件是有机质[有机质泛指土壤中来源于生命的物质，包括土壤微生物和土壤动物及其分泌物以及土体中植物残体和植物分泌物。]。而我国大部分土壤板结问题严重，土壤透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等。
更严重的是有机质极度缺乏破坏了土壤的团粒结构[土壤团粒结构是由若干土壤单粒粘结在一起形成为团聚体的一种土壤结构。]，降低了土壤的保肥保水能力。没有了有机质，菌肥中的菌种就失去赖以生存的条件不能繁衍生存，也就无法发挥作用。
三、土壤不利于微生物存活
果园多年不施有机肥和浅施无机肥，造成土壤板结，存氧量差，根系生长缓慢。土壤pH值发生变化。除草剂在土壤中的残留直接破坏了土壤的团粒结构使土壤中的微生物死亡。
四、对菌种不了解
这菌肥里面添加的菌种不同，作用就不同，销售方只告诉你添加了那种菌，但你得这种菌是什么作用，避免被误导！生物菌肥根据其作用不同，可分为以下5类：
1、有固氮作用[固氮作用（nitrogen fixation） 是分子态氮被还原成氨和其他含氮化合物的过程。]的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮蓝藻等；
2、分解土壤有机物[有机物即为有机化合物。]的菌肥：包括有机磷和复合等；
3、分解土壤中难溶性矿物的菌肥：包括硅酸盐、无机磷等；
4、促进作物对土壤养分利用的菌肥：包括菌根菌等；
5、抗病及**作物生长的菌肥：包括抗生菌、增产菌等。
五、施用温度不对
首先地温要在5～35℃内施用，低于5℃菌种不能发酵繁殖，高于35℃菌种会被烧死。有机菌肥单独施用，不要和大化肥[化学肥料简称化肥。]（氮、磷、钾）混合施用。果农为图方便常和大化肥一起施用，在两棵树中间挖20厘米深、宽25厘米的沟，先把菌肥撒入沟内，再撒大化肥填土，这和混施没有区别，大化肥杀死了菌种。正确的施肥方法应采取放射性沟施，挖30厘米宽、25～35厘米深的沟，先施入大化肥，填一层10厘米左右的土，再施菌肥。这层隔离带减少了大化肥水溶下渗后杀死菌种的机会。
注意：施用有机菌肥的关键要不断培养土壤中的微生物。土壤中有足够的有机物或腐殖质时才能被微生物菌利用，进而使土壤微生物快速繁衍，营养元素。