微生物[微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。]的菌肥的作用越来越大，某种程度上，他决定蔬菜[蔬菜，是指可以做菜、烹饪成为食品的，除了粮食以外的其他植物（多属于草本植物）。]生产经济效益的高低。那么，关于微生物菌肥的具体作用到底是什么呢？
在保护地[世界保护联盟(IUCN)将保护地定义为：通过法律及其它有效方式用以保护和维护生物多样性、自然及文化资源的土地或海洋。]蔬菜生产过程中，由于连年超量施肥，一些没被蔬菜吸收的肥料中的残余成分，就会残存在土壤中，越积越多，对土质造成破坏，引起土壤的盐化、酸化，导致土壤板结，通透性[对物质通过的强弱进行描述的一种形状。]减弱，容易引发蔬菜的多种病害。在蔬菜生产过程中，通过增施微生物菌肥，减少化肥的施用量，可以明显地起到改良土壤，降低生产成本，提高蔬菜品质的作用。这是因为微生物菌肥在施用过程中，可以起到活化土壤，分解被土壤固定的养分，从而提高肥料的吸收利用率，同时微生物菌肥中的微生物，在生长和繁殖过程中，可以产生植物生长素[生长素（auxin）是一类含有一个不饱和芳香族环和一个乙酸侧链的内源激素，英文简称为IAA，其化学本质是吲哚乙酸。]，**作物生长，从而改善蔬菜的品质；其次微生物在生长繁殖过程中，还能抑制多种土传病害的发生和发展，对根结线虫病[线虫病是由线形动物门线虫纲(Nematoda)多种线虫引起的一类蠕虫病。]也具有很强的抑制作用[两对独立基因中的一对显性基因本身不能控制性状的表现,但对另一对基因的显性表现有抑制作用,使F2的表现型比例为13:3,这种现象称为抑制作用。]，微生物菌肥是一种、经济、环保的新型肥料，很值得在保护地蔬菜生产中加以推广应用。
要使微生物肥料在无公害[无公害，指有毒有害物质控制在安全允许范围内，符合《国标》的产品，多指农产品。]蔬菜生产中真正发挥增产增效环保的作用，不仅要让生产者了解微生物肥料的特性和种类，还要对保护地蔬菜进行合理化[合理化（rationalization）：当某一个追求的目标不能实现时，会找某些理由为自己开脱，使自己心理上得到安慰，有时也会找出一些借口来掩饰自己的行为和不愿承认的事实。]施用。还有微生物肥料只是一种辅助增产肥料，不可替代化肥和有机肥[主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。]，无公害蔬菜生产的施肥还应以有机肥为主。