一、黄腐病
1、症状子实体[实体：具有具体而真实的形态或结构的事物，能够为人们所感知与亲手接触。]初期易出现黄褐斑病，随后扩展到整个菇体，菇体停止生长[生长是自然界中存在的一种自然现象。]，最后变黄、变软、腐烂。这是由细菌类假单胞杆菌引起的病害。
2、发生条件高温[高温，词义为较高的温度。](20℃以上)、高湿、通风[通风就是采用自然或机械方法使风没有阻碍，可以穿过，到达房间或密封的环境内，以造成卫生、安全等适宜空气环境的技术。]不良时极易发生。主要是通过水来传染，当子实体含水量过高时易发生。
3、防治方法
①、在出菇期间，当温度[温度（temperature）是表示物体冷热程度的物理量，微观上来讲是物体分子热运动的剧烈程度。]高于18℃时，切勿向子实体喷水，只能向地面和四周墙壁上喷水来增加湿度。
②、出菇期间，要加强通风换气[京剧演唱方法之一。]管理，避免出现高温、高湿环境。每次喷水后，结合进行通风换气管理，降低菇体表面上水分[水分，中医学术语，主治腹痛，腹胀，肠鸣，泄泻，翻胃，水肿，小儿陷囟，腰脊强急等症状。]，可防止细菌性病害。
③、出现病害后，及时摘除病菇，加强通风换气管理，防止传染其他菇体。
二、枯萎病
1、症状杏鲍菇幼菇生长停止，萎缩死亡，最后变黄、腐烂。出现这种现象，主要是高温(22℃以上)引起幼菇死亡，最后出现细菌感染，变黄并腐烂。
2、发生条件子实体生长期间，将温度控制[温度控制是以温度作为被控变量的开环或闭环控制系统。]在10—20℃之间，最高温度不得超过22℃。高温时采取降温措施。幼菇枯萎死亡后，及时摘除，防止细菌繁殖，菇体腐烂，引诱害虫取食繁殖，出现虫害。
三、畸形菇
1、症状子实体长成不规范形状，即为畸形菇，从而降低商品价值。
2、发生原因子实体生长期间，遇到22℃以上高温，抑制了菌盖分化和发育。此外，空气相对湿度[相对湿度（Relative Humidity），指空气中水汽压与饱和水汽压的百分比。]低于70％时，也易长成畸形菇。
3、防治方法合理安排出菇季节，将出菇温度控制在13—20℃之间，避免在20℃以上出菇。子实体生长期间菇房内空气相对湿度保持在80—90％之间，满足子实体生长发育所需水分条件。适时开口出菇，加强通风换气管理，保持菇房内空气新鲜，避免二**碳浓度过高。
另外，出菇时菌丝[单条管状细丝，为大多数真菌的结构单位，一些原核生物也有菌丝，如放线菌。]旺长子实体萎缩或黄化死亡这是菇棚内温度突然升高所致。在出菇阶段，菌丝、子实体都在生长。在正常情况下，这两种生长达到动态平衡。决定这一平衡的关键因素是温度。相对较高的温度有利于菌丝生长，而相对较低的温度有利于原基的分化。突然升温，打破了原有的平衡，使营养生长即菌丝生长占了优势。在营养、水分一定的情况，供给菌丝生长的营养、水分多，供给子实体的营养、水分就少了，严重时子实体营养倒流，在外观上表现出子实体萎缩，甚至枯黄死亡。