微生物[微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。]肥料[肥料是指提供一种或一种以上植物必需的营养元素，改善土壤性质、提高土壤肥力水平的一类物质，是农业生产的物质基础之一。]近些年从肥料界兴起的一种新型肥料，现在在农业生产中微生物肥的施用也是很广泛的，关于微生物肥主要有四大功效，小编为大家介绍如下：
1、提高化肥[化学肥料简称化肥。]利用率[ 此条目暂无内容，欢迎您参与编辑，享受分享知识的乐趣。]的作用
随着化肥的大量使用，其利用率不断降低已是众所周知的事实。这说明，仅靠大量增施化肥来提高作物产量是有限的，更何况还有污染环境等一系列的问题。微生物肥料在解决这方面问题上有独到的作用。所以，根据作物种类和土壤[土壤（英文名称：Soil）位于地球陆地表面，具有一定肥力，能够生长植物的疏松层。]条件，采用微生物肥料与化肥配合施用，既能保证增产，又减少了化肥使用量，降低成本，同时还能改善土壤及作物品质，减少污染。
2、在绿色食品[绿色食品，是指产自优良生态环境、按照绿色食品标准生产、实行全程质量控制并获得绿色食品标志使用权的安全、优质食用农产品及相关产品。]生产中的作用
随着人民生活水平的不断提高，尤其是人们对生活质量提高的要求，都在积极发展绿色农业(生态有机农业)来生产、无公害的绿色食品。生产绿色食品过程中要求不用或尽量少用(或**使用)化学肥料、化学农药[化学农药广泛的运用在农业生产之中。]和其它化学物质。近年来，已用具有特殊功能的菌种制成多种微生物肥料，不但能缓和或减少农产品[农产品（farm produce）是农业中生产的物品，如高粱、稻子、花生、玉米、小麦以及各个地区土特产等。]污染，而且能够改善农产品的品质。
3、微生物肥料在环保中的作用
利用微生物的特定功能分解发酵城市生活垃圾及农牧业[畜牧业主要包括牛、马、驴、骡、骆驼、猪、羊、鸡、鸭、鹅、兔、蜂等家畜家禽饲养业和鹿、貂、水獭、麝等野生经济动物驯养业。]废弃物而制成微生物肥料是一条经济可行的有效途径。目前已应用的主要是两种方法，一是将大量的城市生活垃圾作为原料经处理由工厂直接加工成微生物有机复合肥料[由化学方法或（和）混合方法制成的含作物营养元素氮、磷、钾中任何两种或三种的化肥。]；二是工厂生产特制微生物肥料(菌种剂)供应于堆肥厂(场)，再对各种农牧业物料进行堆制，以加快其发酵过程，缩短堆肥的周期，同时还提高堆肥质量及成熟度。另外还有将微生物肥料作为土壤净化剂使用。
4、改良土壤作用
微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的0.1%，与植物粘液，矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构[土壤团粒结构是由若干土壤单粒粘结在一起形成为团聚体的一种土壤结构。]，增强土壤的物理性能[物理性能即密度、粘度、粒度、熔点、沸点、凝固点、燃点、闪点、热传导性能、电传导性能、磁性能。]和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。
微生物肥料是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品。它是从土壤中分离出的有量微生物，经过人工选育与繁殖后制成的菌剂，是一种辅助性肥料。它具有一些其它肥料没有的特殊作用，所以应用比较广泛。