科学施用肥料[肥料是指提供一种或一种以上植物必需的营养元素，改善土壤性质、提高土壤肥力水平的一类物质，是农业生产的物质基础之一。]是取得番茄[番茄，别名西红柿、洋柿子。]优质高产的关键，它的施肥特点如下。
平衡使用化肥。化肥具有养分含量高、肥效快的特点，合理使用可弥补有机肥[主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。]和土壤中所供给某种营养元素的不足，对提高产量、改善品质同有机肥具有同样的效果，只要平衡使用化肥不会对作物和环境造成危害。番茄常用的肥料品种有：尿素、过磷酸钙[又称普通过磷酸钙，简称普钙，是用硫酸分解磷矿直接制得的磷肥。]、硫酸钾[硫酸钾，是指—种重要的含硫、钾元素的无氯钾肥。]、硼砂、硫酸锌[无色或白色结晶、颗粒或粉末，别名皓矾。]和三元复合肥等。其中过磷酸钙在酸性土壤或旧大棚[随着高分子聚合物－聚氯乙烯、聚乙烯的产生，塑料薄膜广泛应用于农业。]上使用效果较好。有机肥用量大的和旧大棚，可选用用肥量的低限；有机肥用量少的和新建的大棚可选用用肥量的高限。
合理分配基肥[基肥，系指作物播种或定植前、多年生作物在生长季末或生长季初，结合土壤耕作所施用的肥料。]、追肥[追肥，是指在植物生长期间为补充和调节植物营养而施用的肥料。]的比例。依据肥料特点及番茄需肥规律，确定基肥、追肥的比例。一般情况下，有机肥、磷肥、微肥和80%的钾肥、30%的氮肥混匀后做基肥，并将其中的2/3均匀撒于地表，然后翻于**，其余1/3起垄时施在定植行内，其余70%的氮肥和20%的钾肥分别做追肥使用。
番茄进入盛果期后，根系的吸肥能力下降，此时可进行叶面喷肥，常用的方法是每亩每次喷洒1%的尿素溶液加0.5%的磷酸二氢钾[磷酸二氢钾是一种化学品，化学式为KH2PO4。]溶液加0.1%的硼砂混合液40-50公斤，5-7天一次，连喷2,3次，有利于延缓衰老，延长采收期[采收期指中药采收的最佳时间，多用于中药。]。