农作物[指农业上栽培的各种植物。]被水淹如果超过48小时，根部会发黄、发褐以致腐烂！另外，水淹过后会有一段虚弱期，这段时间农作物的抗病能力比较差，及时补救是非常主要的!
1、造成土壤[土壤（英文名称：Soil）位于地球陆地表面，具有一定肥力，能够生长植物的疏松层。]中缺氧[缺氧（hypoxia），是指当组织的氧供应不足或利用氧障碍时，导致组织的代谢、功能和形态结构发生异常变化的病理过程。]
如果土壤水分[土壤水是植物吸收水分的主要来源（水培植物除外），另外植物也可以直接吸收少量落在叶片上的水分。]过多，时间过长，就会缺氧；当温度高时，破坏会加剧；轻则引起根系[根系是一株植物全部根总称。]发育不良，重则引起种子腐烂、不出芽、根系腐烂、新苗(植株)大死；
2、造成根系功能降低
当蔬菜根系缺氧时，呼吸受到控制，根系的汲取能力大大降低；容易导致“生理饥饿”、“生理干旱”或植物倒伏；
3、发生有害养分
由于土壤长期缺氧缺水，厌氧微生物[微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。]非常活跃，土壤中出现的有害养份(如硫化氢[硫化氢，分子式为H2S，分子量为34.076，标准状况下是一种易燃的酸性气体，无色，低浓度时有臭鸡蛋气味，有毒。]、乙烯、氨、甲烷等)会直接毒害根部；
4、造成土壤中肥料流失[流失，泛指有用的东西流散失去。]
肥料容易随着地面水[地面水是指河流，湖泊，水库中的水地面水体是降水的天然汇集场所。]的流出/渗入而流失，尤其是速效氮肥由于厌氧微生物的活性使氨或氮还原而流失；
5、晒死根系
由于流水或雨水的侵蚀，表层土壤流失加剧，根系暴露(翻根或暴露根)！天气晴朗后，在日光照射下，**的根系很容易死亡；
6、诱发病虫害[病虫害病害和虫害的并称，常对农、林、牧业等造成不良影响。]
如果蔬菜长期处于洪水或高温高湿的环境中，容易被有害生物[有害生物，是指在一定条件下，对人类的生活、生产甚至生存产生危害的生物；是由数量多而导致圈养动物和栽培作物、花卉、苗木受到重大损害的生物。]破坏，造成大面积病虫害，特别是细菌性病害；