1、肥料[肥料是指提供一种或一种以上植物必需的营养元素，改善土壤性质、提高土壤肥力水平的一类物质，是农业生产的物质基础之一。]投入[汉语词语【词目】投入【拼音】tóu rù 【基本解释】置身其中；放进去；全身心的做一件事情。]结构不合理，不能合理定性与定量施肥[施肥，是指将肥料施于土壤中或喷洒在植物上，提供植物所需养分，并保持和提高土壤肥力的农业技术措施。]。
有的只施氮肥，有的只施一铵或二铵，有的农户[农户，名词，从事农业生产劳动的人家。]受某些复混肥[复混肥是复混肥料的简称，是含有多种植物所需矿物质元素或其他养分的肥料。]生产厂家或经营销售者的不适宜宣传，每亩肥料投入量仅有40公斤，严重制约了小麦、玉米等粮作产量的提高。
2、施肥管理方面不能因地制宜。
一是在稻区与习惯浇蒙头水的小麦区，基肥施用[施用是一个汉语词语，拼音：shì yòng释义：1. 施行，实行。]比例过大，在灌水早且额度大的条件下，导致径流渗失，降低了肥料养分[有营养的物质或化合物；尤指被绿色植物摄取的和有机合成中应用的化学元素或无机化合物（如硝酸盐） 。]利用率。二是在洪积扇上中部与砂性土区，土壤渗漏严重，一些[词目：一些拼音：yī xiē基本解释：[a number of;a little of;some] 几个；若干-yixie
]农户在施肥后大水漫灌，致使养分流失。三是在玉米秸秆直接还田区，一些农户仅投入少量复混肥，氮素含量低，秸秆分解腐熟与麦苗争肥严重，在低温寡照影响下，小麦苗期分蘖少，冬前群体难以达到一类苗标准。四是不会利用土壤保肥、供肥特性合理安排底追比例。一些砂性土区底施量过大而导致中后期脱肥，一些粘性土区底施量过少，难以形成高产苗情。五是肥料投入成本偏高，种植效益下降。由于农民已习惯施用复混肥料，在众多厂家、众多品牌、众多规格的复混肥产品面前，往往受到虚假宣传影响，不仅使肥料投入成本升高，养分投入结构也不合理，严重制约了生产水平的提高。
3、科学施肥技术的欠缺，已经影响到农作物结构调整。
在调查中发现，一些农户种植西瓜、葡萄，却在中后期大量施用氯化钾，产品酸涩，口味极差，只能大幅降价销售；一些农户改种花生、大豆，为了高产大量施用氮素化肥，结果反而降低了产量。近年来，红薯、土豆种植效益提升，市场需求良好，但很多人并不了解这些块根、块茎类作物的需肥特性，盲目施肥，投入高，产量低，收益少。