科学施用肥料可使有机肥[主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。]升温，有机肥料[有机肥料亦称“农家肥料”。]是农业生产中的重要肥源，在多年的实际生产中各地农民发现，有机肥料施得越多，土壤营养元素[怀孕是人体正常的生理过程，你怀孕之后，一个可爱的胎儿就开始在妈妈的肚子里成长起来。]越向平衡方向发展，越有利于[有利于是指对某人或某一事物有利处，能起到帮助与促进的作用。]作物对养分的吸收和利用。
科学家也进一步探测到，有机肥腐解后可为土壤微生物[微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。]的生命活动提供能量和养料，进而促进土壤微生物的繁殖。微生物又通过其活动加速有机质[有机质泛指土壤中来源于生命的物质，包括土壤微生物和土壤动物及其分泌物以及土体中植物残体和植物分泌物。]的分解，丰富土壤中的养分。有机肥与化肥在同等营养元素环境里相比较，作基肥施用时一般有机肥比化肥效果要好，作追肥施用时经过腐解的有机肥，其效果常常也比化肥要好，尤其在提高农产品[农产品（farm produce）是农业中生产的物品，如高粱、稻子、花生、玉米、小麦以及各个地区土特产等。]品质方面比化肥显现出更大的优势。
目前各方能达成共识的是，有机肥中的有机质分解时产生的有机酸[有机酸是指一些具有酸性的有机化合物。]，能促进土壤和化肥中的矿物质[矿物质（mineral），是地壳中自然存在的化合物或天然元素。]养分溶解，有利于农作物[指农业上栽培的各种植物。]的吸收和利用，所以能够提高化肥利用率[ 此条目暂无内容，欢迎您参与编辑，享受分享知识的乐趣。]，降低化肥使用量，能有效遏制农业面源污染。