水稻基肥一般是指插秧[插秧，指将秧苗栽插于水田中，或指把水稻秧苗从秧田移植到稻田里。]前结合整地[整地（site preparation）是指作物播种或移栽前进行的一系列土壤耕作措施的总称，整地的主要作业包括浅耕灭茬、翻耕、深松耕、耙地、耢地、镇压、平地、耖田、起垄、作畦等。]施入的肥料[肥料是指提供一种或一种以上植物必需的营养元素，改善土壤性质、提高土壤肥力水平的一类物质，是农业生产的物质基础之一。]，具体方法南北方有所不同。北方稻田一般冬闲，可在秋季或春季，将有机肥[主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。]和一部分化肥[化学肥料简称化肥。]撒在田面，通过深翻整地将肥料翻扣于土壤深层，灌水泡田前再撒施[ 撒施(broadcast fertilization)是指将肥料均匀撒于田面或撒后耕作的旋肥方法。]其余的化肥，然后进行耙地、旋耕和拉板整平（俗称“水找平[找平，使物体处于同一水平面。]”）。这种施肥[施肥，是指将肥料施于土壤中或喷洒在植物上，提供植物所需养分，并保持和提高土壤肥力的农业技术措施。]方法相当于全层施肥，作物前期和中后期都能得到足够的养分，使肥料利用率显著提高。也可以在耙地后将肥料撒施于田面，通过水找平实现土肥相融。这种方法的主要优点是能够促进作物前期生长，但因施肥深度较浅，要注意后期是否出现脱肥。
南方稻田情况较为复杂，如果是冬闲田，也可以采用全层施肥方法；或者在前茬水稻收获后及时耕翻晒田，开春时结合施基肥再耕翻1次，晒田数日后灌水泡田，整平插秧；如果是翻压绿肥[绿肥（green manure）是用绿色植物体制成的肥料。]田，则要在绿肥生长盛期翻压，翻压后适当炕晒，泡田沤熟10~15天，整平后再插秧。若对绿肥补施化肥，则应该在绿肥翻压时进行。如果是油菜、小麦等越冬作物[越冬作物，汉语词语，拼音为yuèdōng zuòwù。]的后茬田，特别是双季稻区的三熟田（俗称小春田），因抢收抢插来不及深耕整地，可在前茬增施有机肥，本茬只结合浅耕施用适量化肥，或者免耕插秧后再追施化肥。