菹草的危害
菹草虽然能反应一个地方的水质，但是菹草如果长势过于疯狂，会造成腐烂变质，从而加重水域环境的污染，并且会导致一些湖泊水上游乐项目难以开展。菹草泛滥还会必然导致大量的投入人力物力来治理，造成社会资源的浪费。
菹草的预防
湖泊一般在水质治理之后会投放一些鱼类保持生态平衡，放养一些食草鱼，比如花鲢和鲂鱼，这样就会保证湖水不会过于清澈，阳光照射也不会过于充足，从而就限制了菹草的生长。
菹草的治理
除了生物防治以外，还可以采用人工清理的方法。首先菹草的生长对湖水水位有一定的要求，治理菹草的疯长，可以先将湖水抽干，清理底泥，从而加深湖水水位，其次在湖底撒上一些石灰，使适合菹草生长的酸性环境改变成碱性，就能抑制残留的菹草生长。
还有一个问题就是治理措施实施之后，难免会有一些死去的菹草发生腐烂变质，给湖中藻类生物提供了大量的养分，从而导致藻类泛滥成灾。这种情况下就需要在湖泊两岸的缓坡上种植一些观赏性既高又能改善水质的花卉，比如再力花和睡莲等。